Gilles NEVEZ       
Professeur des Universités - Praticien hospitalier
Parasitologie et Mycologie, CNU 45-2
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FORMATION ET DIPLOMES UNIVERSITAIRES

Baccalauréat Mathématiques et Sciences de la nature, académie de Rennes (1978). Diplôme Universitaire de Pathologie Exotique, Brest (1985). Doctorat en Médecine et DES de Biologie Médicale, Toulouse (1991). Prix de thèse, médaille d’argent. Lauréat de l’Université au titre du prix de thèse (1993). Maîtrise de Sciences Biologiques et Médicales: Parasitologie, Toulouse (1994). DES Complémentaire de Pathologie Infectieuse et Tropicale Clinique et Biologique, Toulouse (1994). Assistant en Parasitologie, Université de Picardie - Jules Verne (UPJV), Amiens (1994-1998). Diplôme de Mycologie Médicale de l’Institut Pasteur, Université de Paris VI (1995). Diplôme d’Etudes Approfondies (DEA) de Parasitologie Lille – Perpignan - Montpellier (1997). Chargé d’enseignement à la Faculté (Disciplines médicales et odontologiques), Amiens (2000). Doctorat en Sciences et santé, Biologie, Parasitologie, Ecole doctorale 0368, Amiens (2002). Habilitation à diriger des recherches, Amiens (2004). Professeur des universités, Brest (2006).

FORMATION ET FONCTIONS HOSPITALIERES

Externe des hôpitaux (étudiant hospitalier), Brest (1983-1986). Interne des hôpitaux, Toulouse (1986-1991). Attaché des hôpitaux, Toulouse et Amiens (1991-1994, 1998-2000). Assistant des hôpitaux, Amiens (1994-1998). Praticien hospitalier, Amiens (2000). Chef de service à titre provisoire (2003-2005). Praticien hospitalier, responsable de l’unité de Parasitologie et Mycologie, Brest (2006).

SOCIETES SAVANTES, ASSOCIATIONS ET GROUPES D'ETUDES, ACTIVITES DIVERSES

Société Française de Parasitologie (1991). Société Française de Mycologie Médicale (1994). Société de Pathologie Infectieuse de Langue Française (1994). Société Française de Médecine des Voyages (1996). Société de Pathologie Exotique (1996). International Society for Infectious Diseases (2004). Association des enseignants de Parasitologie et Mycologie « Anofel » (2000). Réseau français Pneumocystis, responsable de l’équipe F (1998). Réseau européen Pneumocystis, responsable de l’équipe 6 (2000). Centre de ressource biologique et centre national de référence sur T. gondii (Reims - Limoges), équipe associée (2003). Réseau CryptoAnofel (2004). Expert auprès du fonds national suisse de la recherche scientifique. Expert auprès du Wellcome trust, Royaume Uni.

THEME DE RECHERCHE

Le thème de recherche principal porte sur les infections à Pneumocystis jirovecii . Le genre Pneumocystis désigne un groupe de champignons opportunistes présentant une étroite spécificité d'hôte. Ceux-ci déterminent lors d’immunodépression sévère une pneumonie grave, la pneumonie à Pneumocystis (PPC). La transmission de Pneumocystis par aérosolisation entre deux sujets de la même espèce a été démontrée à l’aide de modèles murins. En revanche, aucune forme exo-saprophytique pour aucune espèce du genre Pneumocystis n’a été découverte. Dans ce contexte, nos travaux ont été basés sur le concept de réservoir humain pour P.jirovecii, forme spécifique retrouvée chez l'Homme. Ces travaux menés depuis neuf ans en collaboration avec l’institut Pasteur de Lille (EA 3609) et le CHU Saint-Antoine de Paris ont montré que les patients présentant des infections peu sévères à P.jirovecii constituent la part essentielle des patients infectés par le champignon. Ceux-ci sont représentés par des nourrissons non prématurés développant une infection primaire bénigne à P.jirovecii et par des patients ne développant pas de PPC mais étant simplement colonisés par le champignon. Des méthodes de génotypage portant sur l’analyse des « internal transcribed spacers » 1 et 2 de l'opéron nucléaire de l’ARN ribosomique et du gène codant pour la dihydroptéroate synthétase de P.jirovecii ont montré que les isolats provenant des adultes colonisés ou développant une PPC et ceux provenant des nourrissons présentaient des caractéristiques génotypiques communes. Cette communauté génotypique est en faveur de l’unicité du réservoir humain constitué majoritairement par les sujets présentant des formes peu sévères d’infection, réservoir dynamique au sein duquel pourrait circuler P.jirovecii. Les travaux portant sur ce thème de recherche - ont permis l’encadrement et/ou la soutenance de 2 thèses de l’université, 2 DEA, 5 thèses de doctorat en Médecine ou Pharmacie, d’un DES de Pneumologie, 9 maîtrises (biologie cellulaire et physiologie, master1, sciences biologiques et médicales), 4 DETAB], -ont été valorisés par des 25 publications, 19 communications internationales, 4 conférences internationales sur invitation, -ont été financés par le ministère de l’éducation nationale et de la recherche (programme de recherche fondamental en microbiologie et en maladies infectieuses et parasitaires) et la commission européenne (« 5th program QLK2-CT-2000-1639 ») dans le cadre des réseaux Pneumocystis français et européens, et par un programme hospitalier de recherche clinique (appel d’offre local du CHU d’Amiens).
Les travaux en cours sur le thème seront poursuivis. Ceux-ci portent d’une part, sur la caractérisation du réservoir humain de P.jirovecii représenté par les bronchopathes et d’autre part, sur l’étude du gène de la dihydrofolate réductase du champignon (collaboration Amiens, Lyon, Lausanne, Brest). Ces travaux permettront de promouvoir à brève échéance le thème à Brest tout en maintenant les liens nécessaires avec le docteur A Totet (CHU d’Amiens) et le docteur E Dei-Cas (EA 3609, Lille II). Ceci rendra possible la collecte et l’analyse des isolats de P.jirovecii, et en conséquence, l’obtention à court terme des premières données génotypiques sur le champignon en Bretagne. Ceci permettra en outre de positionner le laboratoire au sein du groupe de travail sur les infections à P.jirovecii de l’ouest et du centre de la France coordonné par le professeur France Roblot à Poitiers. La prolongation du thème Pneumocystis permettra de pérenniser notre participation aux réseaux Pneumocystis français et européen tout en leur apportant une équipe et des moyens supplémentaires. Notre position au sein des réseaux en tant que référent pour le génotypage sur le locus des ITS sera donc maintenue. En ce sens, le projet d’actualisation des méthodes de génotypage par séquençage des ITS sera mené à terme. De même, notre équipe participera durant les deux prochaines années à un projet intitulé « Risque d’exposition à P.jirovecii dans l’environnement hospitalier », actuellement en cours d’expertise auprès de l’Agence française de la sécurité sanitaire de l’environnement et du travail (AFSSET)  (collaboration Amiens, Paris –Saint-Louis, Paris - Saint-Antoine, Maisons-Alfort - ENV, Grenoble - CEA et Brest). Ce thème Pneumocystis s’intègre aisément au thème de l’EA 3882 (« Biodiversité et écologie microbienne », Professeur Georges Barbier, UBO).  Cette équipe sera rejointe en tant que membre dès 2006 tout en restant membre associé de l’EA 3609. L’équipe de l’UBO offre le cadre structuré et des perspectives de collaborations pouvant être mis à profit pour d’aborder en seconde approche un thème plus vaste concernant l’environnement et les protistes impliqués en pathologie médicale en Bretagne ouest.

PUBLICATIONS REPRESENTATIVES (2006-2003, liste non exhaustive)

  G Nevez, E Magois, H Duwat, V Gouilleux, V Jounieaux, A Totet. Apparent absence of Pneumocystis jirovecii in healthy subjects. Clinical Infectious Diseases 2006;42:e99-101 (Impact factor, 3.292)
  CB Beard, P Roux, G Nevez, PM Hauser, JA Kovacs, TR Unnasch, B Lundgren. Strain typing methods for Pneumocystis jirovecii and the applications to molecular epidemiologic studies of Pneumocystis pneumonia. Emerging Infectious Diseases 2004; 10: 1729-1735 (Impact factor, 5.968)
  A Totet, H Duwat, E Magois, V Jounieaux, P Roux, C Raccurt, G Nevez. Similar genotypes of Pneumocystis jirovecii in different forms of Pneumocystis infection. Microbiology 2004; 150: 1173-1178 (Impact factor, 2.897)
  A Totet, S Latouche, P Lacube, JC Pautard, V Jounieaux, P Roux, C Raccurt, G Nevez. Pneumocystis jiroveci dihydropteroate synthase genotypes in immunocompetent infants and immunosuppressed adults living in Amiens, France. Emerging Infectious Diseases 2004; 10: 667-673 (Impact factor, 5.968)
  A Totet, S Latouche, H Duwat, E Magois, P Lacube, JC Pautard, JL Schmit, V Jounieaux, P Roux, C Raccurt, G Nevez. Multilocus genotyping of Pneumocystis jirovecii in patients developing diverse clinical forms of infections: implication for a wide human reservoir for the fungus. Journal of Eukaryotic Microbiology 2003; 50: S 670- S 671(Impact factor, 1.738)
  A Totet, L Meliani, P Lacube, JC Pautard, C Raccurt, P Roux, G Nevez. Immunocompetent infants as a human reservoir for Pneumocystis jirovecii: rapid screening by non-invasive sampling and real time PCR assay at the mt LSU rRNA gene.Journal of Eukaryotic Microbiology 2003; 50: S 668- S 669 (Impact factor, 1.738)
  A Totet, N Respaldiza, JC Pautard, C Raccurt, G Nevez. Pneumocystis jiroveci genotypes and primary infection. Clinical Infectious Diseases 2003; 36: 1340-1342 (Impact factor, 3.292)
  A Totet, JC Pautard, P Roux, C Raccurt, G Nevez. Genotyping at the Internal transcribed spacer of the nuclear rRNA operon of Pneumocystis jiroveci in non-immunosuppressed infants without severe pneumonia. Journal of Clinical Microbiology 2003; 41: 1173-1180 (Impact factor, 3.474)
G Nevez, A Totet, V Jounieaux, JL Schmit, E Dei-Cas, C Raccurt. Pneumocystis jiroveci Internal transcribed spacer types in patients colonized by the fungus and in patients with pneumocystosis from the same French geographic region. Journal of Clinical Microbiology 2003; 41: 181-186 (Impact factor, 3.474)